Procedury odwadniania, odwapniania, zatapiania i barwienia, jakkolwiek bardzo różne są opisane w jednym rozdziale, ponieważ współdzielą jeden typ okna w którym użytkownik rejestruje przebieg procesu.

Rejestracja procesu polega w tym przypadku na odnotowaniu daty i godziny przekazania materiału do procesu, jak również usunięcia materiału z procesu.

Dodanie materiału do procesu może odbyć się na dwa sposoby:

1. ręczne przy użyciu czytnika kodów kreskowych
2. automatyczne przekazanie materiału do kolejnego procesu po zakończeniu procesu poprzedzającego (np. zeskanowanie wytworzonego szkiełka na etapie skrawania może automatycznie przekazać szkiełko do barwienia)

Usunięcie materiału z procesu może odbyć się na trzy sposoby:

1. ręcznie przy użyciu czytnika kodów kreskowych
2. ręcznie przez zaznaczenie grupy materiałów w oknie programu i kliknięcie przycisku 'Usuń zaznaczone'
3. przez dodanie materiału do kolejnego procesu (np. zeskanowanie kasetki na skrawaniu może usunąć ją z procesu zatapiania)

Uwaga! Wszystkie opcje automatyzujące obsługę procesu wymagają zaawansowanej konfiguracji, która odbywa się w menu Administracja –> Proces patomorfologiczny.

System LISPAT pozwala na wykorzystanie kodów kreskowych (1D lub 2D) nadrukowanych na kasetkach, szkiełkach czy etykietach na materiały. (Czytaj więcej w rozdziale dot. materiałów)

System LISPAT domyślnie wykorzystuje jeden czytnik kodów kreskowych wybrany przez użytkownika w ustawieniach jego profilu (czytaj więcej w rozdziale Instalacja i konfiguracja czytnika kodów kreskowych)

Okno procesu patomorfologicznego pozwala na wykorzystanie poza standardowym czytnikiem kodów również dodatkowy czytnik tak że użytkownik może używać dwóch, jeden na wejściu, drugi na wyjściu z procesu.

Każdy z czytników może być osobno skonfigurowany tak, aby dodawał, usuwał, lub też zamiennie dodawał i usuwał materiały z procesu.

Jeżeli materiał jest procesowany zbyt krótko lub zbyt długo, system LISPAT może informować o tym użytkownika zapobiegając usunięciu materiału z procesu zbyt szybko lub zbyt późno. Służy do tego kolumna 'W trakcie', która może przyjmować kolory:

1. żółty - materiał jest procesowany zbyt krótko
2. czerwony - materiał jest procesowany zbyt długo

Dodatkowo, użytkownik ma możliwość skonfigurowania systemu LISPAT tak, aby informował użytkownika o przekroczeniu czasu procesowania w oknie głównym programu.

Użytkownik może włączyć tą opcję w menu Użytkowni –> Edycja profilu –> Zachowanie –> Procesuj.